Mientras que en el Torneo de Transición terminaron en el quinto lugar con 30 puntos a ocho del campeón la Unión Española. El segundo semestre del 2012 no sería tan bueno como el primero para la U, tras no lograr levantar ni la Copa Suruga Bank ni la Recopa Sudamericana, caer eliminados en octavos de final de la Sudamérica rotundamente contra Sao Paulo y caer en cuartos de final del Clausura contra Unión Española.